Công viên Địa chất Phú Yên có nhiều lợi thế, giàu tiềm năng về tài nguyên du lịch. Định hướng quy hoạch phát triển du lịch Công viên Địa chất Phú Yên nhằm đưa du lịch trở thành một động lực trọng điểm trong sự phát triển kinh tế - xã hội của tỉnh. Phát triển du lịch Công viên Địa chất Phú Yên chủ yếu nên dưới hình thức bảo tồn, phát huy giá trị tổng thể các loại hình di sản, khai thác hiệu quả giá trị tài nguyên du lịch. Các sản phẩm du lịch nên gắn liền với các di sản địa chất, di sản văn hóa, đặc biệt là kiểu di sản địa mao, danh lam thắng cảnh. Xây dựng du lịch Công viên Địa chất Phú Yên nên gắn với bốn trung tâm, sáu khu,17 điểm và nhiều tuyến du lịch quốc tế, quốc gia, liên tỉnh và nội tỉnh. Cần thực hiện các giải pháp du lịch bền vững như bảo tồn phát huy giá trị, tuyên truyền giáo dục, tổ chức quản lý… để đưa du lịch Công viên Địa chất Phú Yên trở thành trung tâm du lịch lớn